Dalam aspek tata kelola (Governance), KAI Logistik menegaskan komitmennya terhadap integritas dan akuntabilitas tata kelola perusahaan. Seluruh proses pengadaan telah berbasis digital procurement untuk mendorong transparansi dan efisiensi. Perusahaan juga telah memperoleh sejumlah sertifikasi penting sebagai bentuk pemenuhan terhadap standar tata kelola global, di antaranya ISO 9001:2015 yaitu Sistem Manajemen Mutu, ISO 14001:2015 yaitu Sistem Manajemen Lingkungan, ISO 45001:2018 yaitu Sistem Manajemen Keselamatan dan Kesehatan Kerja, ISO 27001:2022 Sistem Manajemen Keamanan Informasi, ISO 37001:2016 yaitu Sistem Manajemen Anti Penyuapan, hingga Sertifikasi Sistem Jaminan Produk Halal (SJPH) pada layanan angkutan multikomoditas.
”Sebagai bagian dari BUMN, KAI Logistik juga menjunjung tinggi prinsip netralitas politik, khususnya menjelang Pilkada Serentak Agustus 2025. Seluruh pegawai ditekankan untuk tidak terlibat dalam kegiatan politik praktis serta tidak menggunakan fasilitas dan sumber daya perusahaan untuk kepentingan politik apa pun. Hal ini sejalan dengan nilai-nilai integritas dan profesionalisme yang dijunjung tinggi dalam penerapan Good Corporate Governance (GCG),” lanjut Fredi